细菌Dietzia sp.DQ12-45-1b中两种长链烷烃羟化酶基因的鉴定

细菌Dietzia sp.DQ12-45-1b是一株高效石油降解菌,从中已经鉴定了编码膜整合烷烃羟化酶（Alk B）和细胞色素P450类CYP153烷烃羟化酶的基因alk W1和CYP153,该菌能产生不同的表面活性剂以降解不同碳链长度的烷烃,但在不同时期对不同碳源进行降解的机制仍不清楚.通过以二十八烷（C28）为单一碳源培养alk W1缺陷的突变株M 5-5,发现alk W1缺陷降低了菌株对C28的降解能力,但仍具有降解C28的能力.通过对DQ12-45-1b菌株全基因组信息分析,并运用实时荧光定量PCR（real-time PCR）技术,鉴定了两种长链烷烃羟化酶基因,其中G1的氨基酸序列与Acinetobacter sp.DSM17874 alm A的相似性是50%,G2的氨基酸序列与Geobacillus thermodenitrifi cans NG80-2 lad A的相似性是48%.同时,发现Dietzia sp.E1存在基因G1的同源基因（G1α）和G2的同源基因（G2α和G2β）,其中基因G1α与G1的相似性是71%,基因G2α、G2β与G2的相似性分别是34%、87%.Real-time PCR分析表明,在Dietzia sp.DQ12-45-1b及突变株M 5-5中,基因G1和G2的转录水平均因C28的诱导而显著上调.上述对alm A和lad A同源基因的鉴定表明,Dietzia sp.DQ12-45-1b具有独特的烷烃降解多酶体系,是目前报道的烷烃羟化酶最多的细菌之一.