猪繁殖与呼吸综合征病毒（PRRSV）江苏分离株NJGC ORF5基因的克隆及遗传变异分析

为了分析江苏省流行的猪繁殖与呼吸综合征病毒（PRRSV）的遗传变异特征,采用RT-PCR方法对江苏地区分离的PRRSV NJGC株的ORF5基因进行了克隆和测序,利用DNAstar软件与国内外代表性毒株进行了同源性分析与序列对比,并绘制了系统进化树。结果表明：NJGC株属于美洲型PRRSV,其ORF5基因与美洲型代表毒株VR-2332的同源性为90.5%,与中国的经典毒株CH-1a的同源性为92.5%,与中国高致病性PRRSV毒株的同源性在98.0%以上;进化树分析结果显示,NJGC株和高致病性PRRSV在同一进化分支,推测其属于高致病性PRRSV,且与2006年分离的SY0608有更近的亲缘关系,体现了PRRSV具有一定的地域性。同时,该基因编码蛋白的抗原表位和抗原性也发生了变化。依据序列推断PRRSV NJGC株属于具有明显地域性的高致病性PRRSV。