Analyse of an experiment of divergent selection for fleece weight in french angora rabbits

Dans cette these nous presentons une analyse d'une experience de selection divergente chez le lapin Angora francais. Les objectifs de l'experience etaient d'evaluer la reponse a la selection pour le poids total de toison et pour les caracteres correles et d'analyser une experience de selection sur une population conduite en generations chevauchantes. Nous presentons une vue d'ensemble des facteurs genetiques et non genetiques des caracteres quantitatifs et qualitatifs influencant la production de fibre. Parmi des effets fixes, le numero de recolte est le plus important. Les parametres genetiques et les tendances genetiques ont ete analyses en utilisant un BLUP applique a un modele animal. Pour l'estimation des parametres genetiques on a employe un modele avec mesures repetees des mesures dans lequel les recoltes successives ont ete considerees comme un caractere repete. Les resultats ont prouve que la selection pour le poids total de toison a ete efficace et une divergence de trois ecarts types genetiques a ete observee entre les souches haute et basse apres huit annees de selection. La selection pour le poids total de toison a augmente de maniere significative la longueur de jarres et le rapport entre les nombre de follicules secondaires et primaires (rapport S/P). Dans le meme temps, la compression, la resilience, le diametre de duvets, et le diametre moyen de fibre ont diminue. Ces changements s'expliquent par des correlations genetiques moyennes a elevees entre le poids de toison et la longueur des jarres, et entre les dimensions de fibre et le rapport S/P, la compression et la resilience. Ainsi, la selection pour augmenter le poids total de toison a induit une augmentation des composantes quantitatives et qualitatives de la production delaine du lapin Angora francais. La mesure du poids total de toison est simple et facile au niveau de l’elevage. Cette these fournit egalement de nouveaux parametres genetiques resultant des mesures par l'analyseur de diametre de ibre optique (OFDA). Il s'agit d'une methode rapide pour mesurer les caracteristiques de la fibre Angora. Certaines de ces mesures sont interessantes en raison d'une correlation genetique elevee avec les caracteristiques du follicule pileux. La methodologie OFDA est une alternative interessante pour evaluer des caracteristiques importantes telles que le diametre de fibre et le coefficient de variation du diametre des fibres. Nous decrivons les parametres demographiques et genealogiques de la population etudiee. En outre, nous etudions la differentielle de selection pour le poids total de toison et le poids corporel. La caracteristique principale de notre approche est la description de la differentielle de selection en comparant les candidats a la selection, les parents potentiels et les parents theoriques. La description demographique et genetique a prouve que dans les deux souches selectionnees on a applique pendant 8 ans une conduite proche. Notre travail apporte des resultats originaux sur les effets de la selection chez le lapin angora et sur la conduite d'une selection en generations chevauchantes. Cette these a aussi un interet pratique pour les selectionneurs de lapin Angora. Cette these est egalement le dernier projet de recherche de l'INRA apres presque 30 ans de recherche sur cet animal. ABSTRACT : In this thesis, we present our research to analyze the efficiency of an experiment of divergent selection in French Angora rabbit. Objectives of the experiment were a) to assess genetic parameter estimatesfor total fleece weight and correlated trait and b) to get an experience on management of a population of angora rabbits under selection with overlapping generations. This thesis is also the last research project of INRA after nearly 30 years of research on this animal. We present an overview of the genetic and non-genetic factors of quantitative and qualitative traits influencing fibre production. Among fixed effects, number of harvest was the most important. The genetic parameters and genetic trends were analysed using a BLUP animal model. For estimation of genetics parameters the repeatability model was used in which wool harvests from third until 12th have been considered as a repeated trait. Results showed that selection for high and low total fleece weight was successfully performed and a divergence of three genetic standard deviations was observed between the high and low lines after eight years of selection. Selection for total fleece weight significantly increased bristle length, secondary to primary follicle ratio and comfort factor and decreased compression, resilience, bristle diameter, and average fibre diameter. These changes resulted from moderate to high genetic correlations between total fleece weight and bristle length, and between fibre dimensions and secondary to primary follicle ratio, comfort factor, compression and resilience. Thus, selection for increasing total fleece weight results in an increase of both quantitative and qualitative traits of wool production in the French Angora rabbit. Measurement of total fleece weight is simple and easy at the farm level. Selection for this trait has positiveeffects on fleece characteristics such as bristle length, follicle population and fibre diameter. This thesis also contains new genetic parameters Angora fibres resulting from measurements by Optical Fibre Diameter Analyser that we provide a rapid method for measuring the characteristics of Angora fibre. Some of these measurements are interesting because of having a high genetic correlation with follicle traits of skin. The OFDA methodology is an interesting alternative to evaluate important characteristics such as fibre diameter, CV of fibre diameter and bristle content through measuring of comfort factor. We describe the demography and genealogy of the studied population. In addition, we study differential of selection for total fleece weight and body weight. The main characteristic of our approach is the use of new method for description of differential of selection in candidates of selection, parent and theoretical parents. Description of demography and the genetic structure in this study showed that in the two divergent lines, the similar management of reproducers has been done successfully during 8 years of selection. Our work contributes to the research in two areas that are estimation of genetic parameters with multivariate models of best linear unbiased prediction of breeding value and theoretical investigation of selection in populations with overlapping generations. This thesis is also of practical interest for Angora rabbit breeders for knowledge of effects of selection for total fleece weight and correlated traits.