Výskyt plazmidově vázané rezistence ke kolistinu u bakterií z odpadních vod v České republice

Voda z cistirny odpadnich vod (COV) může sloužit jako rezervoar bakterii rezistentnich k antimikrobikům, vcetně kolistinu využivanemu k lecbě infekci vyvolaných multirezistentnimi gram-negativnimi bakteriemi. Sledovani genů rezistence v odpadnich vodach napomaha predikovat výskyt bakterii rezistentnich k antimikrobialnim latkam v populaci lidi, zviřat a prostředi. Cilem teto pilotni studie bylo sledovat výskyt genů mcr kodujicich plazmidově vazanou rezistenci ke kolistinu v odpadnich vodach CR, detekovat tyto bakterie a bliže je charakterizovat. Celkem bylo vysetřeno 14 vzorků odpadnich vod pochazejicich z COV v Jihomoravskem (n=11) a Středoceskem kraji (n=3) odebraných v letech 2018 – 2019 (březen). 25 ml vzorku bylo pomnoženo v pufrovane peptonove vodě a inkubovano při 37 °C přes noc. Pote byla izolovana celkova DNA a metodou PCR detekovany geny mcr-1 až mcr-8. Soucasně byla provedena inokulace na Brilliance UTI Clarity agar s přidavkem kolistinu (3,5 mg/L). Ziskane izolaty byly identifikovany metodou hmotnostni spektrometrie (MALDI-TOF MS) a přitomnost genů mcr byla ověřena metodou PCR. U vybraných izolatů (n=7) byla provedena celogenomova sekvenace (WGS) a detailni analýza genomu (MLST, serotyp, rezistence, přitomnost a charakterizace plazmidů). Vsechny vzorky odpadnich vod byly po izolaci celkove DNA pozitivni na výskyt některeho z mcr genů. Nejcastěji byl detekovan gen mcr-1 (13/14) a dale geny mcr-4, mcr-5, mcr-3 a mcr-8 (10/14, 9/14, 8/14 a 1/14). Geny mcr-2, mcr-6 a mcr-7 nebyly v testovaných vzorcich prokazany. Pouze z osmi (57 %) vzorků byly izolovany bakterie nesouci některý ze sledovaných genů. Bylo ziskano 10 izolatů E. coli nesoucich gen mcr-1 a dva izolaty Aeromonas spp. s genem mcr-3. Výsledky WGS prokazaly vysokou heterogenitu (MLST i serotypu) a multirezistenci u testovaných izolatů E. coli. Gen mcr-1 bylo možne lokalizovat u sesti E. coli na plazmidech typu IncX4 (n=4), IncI2 (n=1) a IncP1 (n=1). Výsledky studie potvrzuji rozsiřeni plazmidově vazane rezistence ke kolistinu u bakterii v odpadnich vodach v CR. Možnost horizontalniho siřeni genů mcr v odpadnich vodach a dale ve vnějsim prostředi může představovat hrozbu pro veřejne zdravi.