Diversität und Merkmale kultivierbarer Bakterien in Böden

Nach der taxonomischen Zugehorigkeit der kultivierbaren Bacteria in Boden (sie stellen etwa 0,1% bis 20% der mikroskopisch sichtbaren Zellen) entfallt die uberwiegende Mehrzahl auf die „Vier Grosen“ Phyla: Actinobacteria > Firmicutes > Proteobacteria > Bacteriodetes. Im Allgemeinen gehoren die meisten kultivierbaren Bakterienisolate zu den Proteobacteria (∼ 54%), Actinobacteria (∼ 23%), Firmicutes (∼ 14%) und Bacteriodetes (∼ 6%). Somit unterscheiden sich die haufigsten isolierbaren Bacteria aus Boden in der Reihenfolge deutlich von der allgemeinen Haufigkeit der kultivierbaren Bacteria. Wenn die Haufigkeit der 16S-rRNA und 16S-rRNA-Gensequenzen in den Datenbanken (Kap. 4 und 7) einmal als Indikator fur die taxonomische Zugehorigkeit der dominanten Boden-Bacteria zugrunde gelegt wird, dann wurden Vertreter der Proteobacteria, Acidobacteria, Actinobacteria, Verrucomicrobia und Bacteriodetes die dominanten Vertreter stellen (Janssen 2006). Dieses Ergebnis kann zwar nicht als reprasentativ fur die taxonomische Zugehorigkeit der haufigsten Bacteria gelten, doch gibt es Aufschluss uber die Diversitat von bisher nichtkultivierbaren Bacteria in Boden (Kap. 7).