Le complexe Candida parapsilosis : étude moléculaire des souches isolées au CHU Sfax, Tunisie

Actuellement, le complexe Candida parapsilosis est compose grâce a la biologie moleculaire de trois especes phenotypiquement identiques et genotypiquement differentes : C. parapsilosis sensu stricto, Candida orthopsilosis et Candida metapsilosis . En Tunisie, les donnees relatives a ce complexe sont limitees. Ainsi, le but de notre etude etait de determiner par la PCR-RFLP du gene SADH et le sequencage des regions ITS, la repartition des especes au sein de ce complexe chez 182 isolats identifies comme C. parapsilosis par des methodes phenotypiques. Apres amplification par les amorces S1F et S1R du gene SADH , des bandes de taille de 717 pb ont ete revelees par gel d’agarose. Apres la digestion par l’enzyme de restriction Ban I, nous avons obtenu 3 profils : A (196 et 521 pb) pour 172 souches, B (375, 189, 93 et 60 pb) pour 6 souches et C (717 pb) pour 4 souches. Ces profils correspondaient respectivement a C. parapsilosis sensu stricto, C. metapsilosis et C. orthopsilosis . Une PCR-sequencage des regions de l’ADN ribosomal, realisee pour 52 souches, a permis de confirmer les resultats de la PCR-RFLP. Pour les 42 souches de C. parapsilosis sensu stricto, un seul type de sequence ITS (KT948326) etait observe. Pour les 6 souches de C. metapsilosis , trois types de sequences ITS ont ete observes et deposes dans la base de donnees GenBank sous les numeros d’accession : KU665248, KU665249, KU665250, KU665251, KX421284 et KU665252. Pour les 4 souches de C. orthopsilosis , deux types de sequences ITS etaient detectes et deposes dans la base de donnees GenBank sous les numeros d’accession : KU665253, KU665254, KU665255, et KU665256. Pas de correlation statistiquement significative etait observee entre le type de sequence ITS et le site d’infection pour C. metapsilosis et C. orthopsilosis. La repartition des especes au sein de ce complexe etait : 94,5 % de C. parapsilosis sensu stricto, 3,3 % de C. metapsilosis et 2,2 % de C. orthopsilosis. La PCR-RFLP etait capable d’identifier et de differencier les especes du complexe C. parapsilosis . Cette methode est devenue la technique de reference et classique dans de telles etudes. C. orthopsilosis semble etre le plus heterogene des especes « psilosis ». Cette surveillance de notre epidemiologie locale s’avere necessaire vue les differences sur le plan virulence et sensibilite aux antifongiques de ces trois especes, pouvant avoir d’importantes implications cliniques et therapeutiques.