X染色体60149273位点在脂尾(臀)和瘦尾绵羊品种中的多态性及其基因定位

2013 
[目的]研究绵羊x染色体60149273位点在不同沉脂尾型绵羊品种中的多态性,为解析绵羊尾脂沉积性状的遗传机制提供基础数据。[方法]首先,采用PCR—SSCP分型方法检测X染色体60149273位点在不同脂尾类型绵羊品种的多态性,并借助PER产物直接测序的方法确认各基因型相应序列,利用卡方检验的方法检测各基因型分布在不同品种中的平衡性。其次,利用生物信息方法将该SNP定位与绵羊androgenreceptor(AR),并使用电子克隆的方法克隆出绵羊一日全长编码序列。同时以阿勒泰羊臀部脂肪RNA为材料,采用RT—PCR的方克隆绵羊彳月第3—8外显子序列,利用生物信息学方法分析序列同源性以及序列的物种进化保守性。[结果]①PCR—SSCP结果显示,在脂尾(臀)型绵羊品种阿勒泰羊和湖羊群体中x染色体60149273位点未检出多态性,GG基因型占100%;而瘦尾(臀)型绵羊品种中国美利奴和萨福克羊群体中则出现了多态性,GG基因型分别下降至1O%和21%。②利用比较基因组学首次电子克隆出该SNP所属基因AR的全长编码区,并从阿勒泰羊臀脂mRNA中成功扩增羊源一月第3—8外显子片段,测序结果与电子克隆序列完全一致。③物种同源性比对进一步显示,一月在哺乳类动物中高度保守,哺乳动物各物种问同源性高达90%;进化树分析结果显示,牛、绵羊、海豚和猪等哺乳动物亲缘较近。[结论]首次发现绵羊彳斤第3内含子一处SNP在脂尾(臀)与瘦尾绵羊品种中存在较大差异,该SNP将可作为一个分子标记运用于低脂绵羊新品种的培育,同时该SNP所属爿月也可作为一个重要候选功能基因应用于绵羊尾(臀)脂沉积分子机制的相关研究。
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