Caracterización de la proteína Hfq en la bacteria TFA

Las bacterias detectan diferentes senales procedentes del entorno y responden a ellas especificamente variando sus perfiles de expresion genica con el objetivo de adaptarse mejor a los cambios ambientales. Dichos mecanismos de regulacion de la expresion genica pueden operar tanto a nivel transcripcional como a nivel post-transcripcional y responden a senales especificas y/o globales para asegurar una correcta expresion genica. Esta regulacion post-transcripcional de la expresion genica puede estar mediada por sRNAs (smallRNAs en ingles). Estos sRNAs tienen un papel crucial en el control de las funciones celulares tales como, por ejemplo, el metabolismo central o la virulencia en algunas bacterias patogenas (1). Se ha descrito que la proteina Hfq juega un papel esencial en la actividad de algunos de estos sRNAs con los que interacciona en numerosas bacterias (1, 2). Hfq fue descrita por primera vez en la bacteria E. coli como un factor esencial para la replicacion del fago Qβ , un virus de ARN (3). Hfq se engloba dentro de la familia de proteinas Sm-Sm_like que se caracteriza por tener una estructura cuaternaria en forma de anillo hexamerico que le permite la interaccion con otras macromoleculas, como serian los sRNAs y los ARN mensajeros diana de los anteriores (1, 2).  La bacteria Sphingopyxis macrogolitabida estirpe TFA es una alfa-proteobacteria perteneciente a la familia Sphingomonadaceae capaz de degradar el contaminante ambiental tetralina y utilizarlo como fuente de carbono y energia (4). En dicha bacteria, objeto de estudio en este trabajo, se ha detectado un gen que codifica para una proteina reconocible como hfq pero con una estructura primaria diferente a las descritas hasta el momento en otras bacterias. estas diferencias encontradas a nivel estructural en la proteina junto al hecho de que no haya estudios previos sobre esta proteina en esta familia de bacterias hacen muy interesante su caracterizacion con objeto de determinar si su mecanismo de actuacion en la celula es diferente o no al descrito previamente en otras bacterias.