Epidémiosurveillance dans les Antilles de génotypes impliqués dans l'adaptation à des résistances variétales chez le champignon Pseudocercospora fijiensis causant la maladie des raies noires du bananier.

2018 
La gestion de varietes resistantes aux parasites necessite la mise en place d'une epidemiosurveillance de genotypes les contournant ou les erodant. C'est le cas notamment de la maladie des raies noires du bananier, grave maladie foliaire provoquee par le champignon Pseudocercospora fijiensis qui a ete recemment introduite dans les Antilles francaises. Des niveaux de maladie eleves ont ete observes recemment en Guadeloupe. L'existence de souches tres agressives dans cette ile a ete confirmee par inoculation en laboratoire. L'etude de l'histoire des populations de P. fijiensis dans les Caraibes nous amene a suspecter une introduction dans les Antilles francaises de genotypes se sont auparavant adaptes a des resistances varietales dans d'autres iles. Alternativement, ces genotypes pourraient etre issus d'un brassage genetique entre deux fonds genetiques differents introduits dans les Antilles francaise. Pour tester ces hypotheses, nous proposons tout d'abord de developper des approches de genomique des populations et genetique d'association afin d'identifier les genes impliques et d'elucider l'origine des genotypes des souches tres agressives. L'implication de ces genes dans la pathogenicite et l'adaptation sera ensuite validee par des inoculations en laboratoire et des analyses d'expression de genes. Enfin, a partir de ces informations, nous developperons des outils moleculaires de detection afin de mettre en place une epidemiosurveillance de ces genotypes.
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