苹果生长素响应因子（ARF）基因家族全基因组鉴定及表达分析

生长素响应因子（auxinresponsefactor,ARt）基因在调控生长素响应基因和生长素信号转导途径以及其它多个生长发育过程具有重要作用。本研究利用BlastP程序比对并获得苹果ARF基因家族，通过DNAMAN6．0、MEGA5．0、WebLogo3、Maplnspect和MEME软件对苹果4尺，基因进行分析，采用RT-PCR技术研究基因组织表达情况。结果表明，苹果基因组存在29个爿灯基因，进化上可分为Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ和Ⅴ组，每组成员数目分别是4、5、10、6和4个。内含子和外显子结构分析表明，该基因家族由2-15个外显子构成。染色体分布结果显示，MdA腿因在染色体上分布不均匀。分别鉴定出4对和2对朋幽腿因经历了串联复制和片段复制，14个MdARF基因经历了全基因组复制。保守元件分析表明，苹果4腿因家族DBD区域、ARF区域、Ⅲ元件和Ⅳ元件结构高度保守。半定量结果表明，大多数MaaRF基因在根、茎、叶、花和果中均有表达。