基因间长链非编码RNA RP11-488L18.10在胆管癌中的表达及其与预后的关系

目的筛选胆管癌（CCA）中关键基因间长链非编码RNA（lincRNA）,并研究其表达与患者预后的关系。方法 CCA表达量和临床数据来自于人类癌症基因组图谱（TCGA）。数据集GSE107943 CCA表达数据获取自高通量基因表达数据库（GEO）。利用R软件进行差异性基因分析,确定肿瘤和正常样品之间显著差异性表达的lincRNA;筛选关键lincRNA。使用受试者工作特征曲线（ROC曲线）分析基因表达对CCA的诊断意义。使用Kaplan-Meier生存曲线分析患者预后。基因富集分析分析显著富集分通路。实时荧光定量PCR验证临床样本中基因表达。结果通过筛选得到451个同时在TCGA和GSE107943数据集上调的lincRNA和154个同时两个数据集下调的lincRNA。在TCGA和GSE107943数据集中lincRNA RP11-488L18. 10在肿瘤组织中丰度较高。利用TCGA和GSE107943数据集对lincRNA RP11-488L18. 10的表达与CCA的关系进行ROC曲线分析,结果显示,TCGA中AUC=1,P