Анализ связывания олигонуклеотидов на микрочипах: энергетические изотермы гибридизации

Данные экспериментов по связыванию олигонуклеотидов-мишеней на биологических микрочипах могут быть представлены при помощи энергетических изотерм гибридизации – завиримостей насыщения ячеек микрочипа молекулами мишени от свободной энергии образования комплекса зонд–мишень (энергии гибридизации D G ). Такое представление позволяет решать задачи «дизайнирования» микрочипов: подбора молекул зондов, которые позволят микрочипу работать эффективно в самом широком диапазоне концентраций мишеней. Ранее экспериментально был обнаружен эффект смещения энергетических изотерм гибридизации: при увеличении концентрации мишеней наблюдается их вертикальный сдвиг. Нами проанализировано поведение энергетических изотерм гибридизации и предложена модель, позволяющая описать экспериментальные данные и количественно объяснить эффект смещения.