鸭 RIG-1 启动子克隆、序列分析及在鸭胚胎期发育性表达

RIG-1属于细胞内蛋白, 与细胞增殖、分化和天然抗免疫功能密切相关。为研究RIG-1在鸭胚胎期免疫器官发育中的作用, 本研究克隆得到鸭 RIG-1 启动子并做生物信息学分析, 应用实时荧光定量PCR技术检测 RIG-1 基因以及预测得到的多个转录因子在鸭胚胎免疫器官发育过程中的表达模式。结果表明, 扩增得到鸭 RIG-1 基因启动子4 372 bp。序列分析表明, 该基因启动子存在典型的TATA-box、CAAT-box调控元件, 有IRF-1、RXR、RAR、AP1、NF-κB、SP1、IL6及Pax-2等多个转录因子结合位点。此外, RIG-1 启动子预测发现了一个CpG岛, GC含量65.8%。定量结果发现, RIG-1 在鸭胚胎免疫器官中表达呈动态性, 具有不同的表达模式; 并在法氏囊中的表达量高于脾脏和胸腺。聚类热图显示, 只有在法氏囊中 RIG-1 与IRF-1、RXR、AP1、NF-κB、IL6的mRNA表达量具有相似的表达模式, 这可能是由于在鸭胚胎期法氏囊具有较为完整的结构与功能, 暗示它们可能为 RIG-1 的转录因子; 而在法氏囊、脾脏和胸腺中, RIG-1 与 IRF-1 、 NF-κB 基因都有较为相似的表达模式, 在3个组织当中均被聚类在一起, 说明IRF-1和NF-κB可能参与调控 RIG-1 的表达。研究结果为探索鸭 RIG-1 基因转录调控、表达，与在细胞增殖、分化、天然抗病毒免疫方面的功能提供了依据和方向。