Finite element models and molecular dynamic simulations for studying the response of mast cell under mechanical activation

在 micropipette 渴望实验，增加用于房间膜的机械应力导致了能被一个禁止者禁止的桅杆房间以及水流的 degranulation，它为短暂受体潜力 vanilloid (TRPV ) 是特定的隧道。为了决定 TRPV 的敏感到膜紧张和紧张，并且增加，进 TRPV，桅杆房间的有限元素模型和人的 aquaporin-1 的分子的动态模拟的激活机制的新卓见被介绍。在有限元素模拟期间，支撑到 micropipette 渴望的房间膜被模仿，并且沿着膜厚度方向的种类分发被获得。而且，联合把发成送气音进比较的 micropipette 和其它的造骨细胞的有限元素模型当模特儿，我们检验了在房间之间的关系机械属性和机械刺激并且介绍了一个新观点决定房间等价物橡皮模量。就 TRPV 水晶结构的不确定而言，人的 aquaporin-1 ，一个种隧道膜蛋白质，代替 TRPV ，被学习了与分子动态( MD )模拟，在在桅杆房间被获得了的不同外部侧面的紧张下面有限元素模拟，在膜隧道上调查机械刺激效果。模拟证明人的 aquaporin-1 经历重要 conformational 变化并且根据侧面的紧张膨胀，它不仅证实以前的 electrophysiological 实验的趋势而且带我们到 TRPV 的更好的理解。联合有限元素模拟和 MD 模拟的多尺度的学习是在房间系统的机械机制的领域里的重要突破。