Análisis preliminar de la estructura primaria y secundaria del ARNtTrp en tortugas marinas

Actualmente existen siete especies de tortugas marinas, todas amenazadas o en riesgo inminente de extincion. Los estudios con ADN mitocondrial han permitido hacer acercamientos sobre filogenia, evolucion, rutas migratorias y centros de dispersion, ademas para la identificacion de polimorfismos y haplotipos, siendo base para planes de manejo y conservacion. El presente estudio representa la primera descripcion comparada de la estructura primaria y secundaria del ARNt Trp mitocondrial en tortugas marinas. Se realizo un alineamiento multiple de 26 secuencias del gen que codifica para el ARNt Trp y se propuso la estructura secundaria utilizando el programa ARWEN. Se identificaron potenciales interacciones terciarias por homologia comparada con el ARNt Trp de mamiferos. Los resultados mostraron una secuencia consenso de 76 bases con siete regiones conservadas que representan el 76 % de la molecula. Se identificaron polimorfismos que representan tres haplotipos para C. caretta , dos para C. mydas y uno para cada una de las demas especies. Las estructuras secundarias mostraron cambios nucleotidicos puntuales para cada especie y tambien mostraron que el tallo aceptor, el brazo TψC y el bucle anticodon son motivos conservados en el ARNt Trp de las tortugas marinas. Se encontro un enlace no canonico tipo A-A en el tallo DHU que podria considerarse caracteristico de tortugas marinas. Ademas, se obtuvo una estructura secundaria consenso en donde se identificaron las siete regiones conservadas, seis posibles interacciones terciarias y el bucle DHU como region variable.