Yaygın Salmonella Serovarlarının Moleküler Tekniklerle Tiplendirilmesi

Bu calismanin amaci, Veteriner Kontrol Merkez Arastirma Enstitusu (VKMAE), Bakteriyolojik Teshis Laboratuvari sorumlulugunda 2009-2011 yillari arasinda Salmonella Prevalans calismasi kapsaminda, Kauffmann-White serotiplendirme semasi ile tiplendirmesi yapilan toplam 907 Salmonella izolatinin, serogrup Salmonella multiplex- PZR, Faz 1 Salmonella multiplex-PZR ve Faz 2 Salmonella multiplex-PZR kullanarak sahada yaygin olarak sirkule olan Salmonellla serovarlari icin dizayn edilen primerler ile maksimum 2-3 gun gibi kisa surede, dusuk maliyetle tiplendirmesini yapabilmektir. Bu calismayla, konvansiyonel yontemle faz 1 ve faz 2 antijenlerinin es zamanli sergilenmemesi sonucunda ekstra laboratuvar is yuku, olasi carpraz reaksiyonlar sebepli ekstra antiserum harcanmasi dolayisiyla yasanilan zaman kaybi ve yuksek maliyetin ustesinden gelinecegi ongoruldu. Ayrica, 2 testin (multiplex-PZR ve konvansiyel serotiplendirme) ortusmedigi durumlar bakterilerin 6.5 kb operonunu inceleyen ribotiplendirme destegiyle cozulmesi yoluna gidilmistir. Calismada kullanilacak primerler ile 907 izolatin % 29.32’sinin (266 izolat; 15 farkli serovar) uc antijenik yapisi da tam olarak identifiye edilip, isimlendirilebilmistir. Incelenen izolatlarin somatik, flagellar 1 ve flagellar 2 antijenlerinin sirasiyla; %54.56 (490), %90.95 (825) ve %78.94 (716)’u tespit edilebilmistir. Izolatlarin en azindan % 50’sinin tam olarak isimlendirilebilecegi ongorulmustur ancak Salmonella Infantis (S. Infantis) ve S. Mbandaka susarinda somatik antijeni amplifiye eden primer olmasina ragmen somatik antijen tespit edilememistir. Bu suslar ribotiplendirmeye alinmistir. Konvansiyonel seroloji, multiplex-PZR ve ribotiplendirme degerlendirildiginde; ribotiplendirme ve multiplex-PZR’larin gold standart metoda destek metodlar olarak kullanabilecegi tespit edilmistir. Ozet olarak; calismada mevcut olan primerler sadece sahada yaygin olan serovarlarin somatik, faz 1 ve faz 2 antijenlerine spesifik olduklari icin PZR tum serovarlari identifiye etmekte yetersiz kalmistir. Sonuc olarak ucuz, hizli ve duyarli metot olan multiplex-PZR’larin belirli somatik, flagellar 1 ve 2 antijenlerinin tespitinde konvansiyonel serolojik yonteme destek olarak kullanilabilecegi kanisina varilmistir.