The use of MALDI-TOF ICMS as an alternative tool for Trichophyton rubrum identification and typing
2014
Objetivo
En este estudio se investigo el potencial de matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight intact cell mass (MALDI-TOF ICMS) para la identificacion de aislados clinicos. Los aislados fueron analizados al nivel de especie y de cepa.
Metodos
Se realizo una identificacion espectral mediante MALDI-TOF ICMS de todas las cepas que se comparo con los resultados de secuenciacion de la region espaciadores transcritos internos (ITS1 e ITS2) y el ADNr 5,8S. Los analisis PCR fingerprinting usando los primers M13, (GACA)4 y (AC)10 se realizaron con la intencion de evaluar la variabilidad intraespecifica de las cepas de Trichophyton rubrum.
Resultados
La identificacion de las cepas al nivel de especie mediante MALDI-TOF ICMS concordo con la ID realizada retrospectivamente en el analisis morfologico y bioquimico. La secuencia de datos confirmo la identificacion por espectro de masas a nivel de especie. Se evaluo la variabilidad intraespecifica. Dentro del cluster de T. rubrum, las cepas se distribuyeron en subgrupos menores y muy relacionados con valores de similaridad superiores a 85%.
Conclusiones
Se demuestra que MALDI-TOF ICMS es una herramienta alternativa rapida, de bajo coste y precisa para la identificacion y tipificacion de cepas de T. rubrum
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