Montagem de cariótipos de peixes assistida por computador
2019
A obtencao de cariotipos de peixes desempenha um papel importante em estudos de citotaxonomia e evolucao cromossomica das especies. No entanto poucos sistemas semi ou completamente automatizados para a obtencao de cariotipo de peixes estao disponiveis. Este trabalho propoe e avalia uma ferramenta baseada em imagens que auxilie a montagem de cariotipos de peixes. As especies analisadas foram Hoplias malabaricus (Bloch, 1794); Hypostomus ancistroides (Ihering, 1911) e Parauchenipterus galeatus (Linnaeus, 1766); popularmente conhecidas como traira, cascudo e bagre sapo, respectivamente. Um total de 100 metafases mitoticas foram analisadas por dois metodos: 1 – geracao semiautomatica de cariotipo e 2 - geracao automatica de cariotipo. Os resultados foram analisados por meio da correlacao de Pearson, graficos de diferencas e tabelas de contagens. A avaliacao do sistema foi feita utilizando-se como referencia a media das contagens feitas por quatro usuarios. No metodo 1 quatro usuarios realizaram contagens nas 100 metafases apresentando correlacao interobservador de r ≥ 0.997. O numero total de cromossomos identificados pelo metodo 1 foi 4348 e para o metodo 2 foi 4135, excluindo 1,3% de falsos positivos, resultando em uma identificacao automatica de aproximadamente 95,1% dos cromossomos presentes nas imagens. Os falsos negativos representam 4,9% do total de cromossomos. A correlacao entre os dois metodos foi de r = 0.93. Os resultados indicam que a ferramenta pode ser inserida no procedimento de cariotipagem de peixes para acelerar o processo com niveis aceitaveis de exatidao.
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