拟南芥转酮醇酶蛋白AtTKL1的同源建模及与 α -三联噻吩结合作用分析

以玉米转酮醇酶(1ITZ)的晶体结构为模板, 对拟南芥转酮醇酶(AtTKL1)的三维结构进行模拟和优化. 利用生物信息学方法, 确定其氨基酸结合位点为His143, Gly234, Asn263, Arg434, Ser461, Gln488, Phe515, His539, Asp547和Arg598, 催化氨基酸位点为His103和His340. 通过分子模拟确定 α -三联噻吩与AtTKL1的活性口袋可有效结合, 且AtTKL1的催化位点和结合位点为其与 α -三联噻吩结合的关键位点. 利用荧光猝灭光谱技术确定AtTKL1与 α -三联噻吩之间存在结合作用; 酶活力检测结果表明加入 α -三联噻吩后转酮醇酶蛋白的活性降低, 进一步验证了AtTKL1与 α -三联噻吩之间的相互作用.