Complexe Candida parapsilosis : résultats préliminaires de l’identification moléculaire de 26 souches

Introduction et objectifs Candida parapsilosis est une levure saprophyte de la peau, caracterisee par son affinite pour les catheters, responsable d’un large eventail de manifestations cliniques dont les candidemies, infections de pronostic redoutable. C’est un complexe genetiquement heterogene comportant trois groupes distincts : Candida parapsilosis (groupe I), Candida orthopsilosis (groupe II) et Candida metapsilosis (groupe III), phenotypiquement identiques. L’objectif de notre travail etait l’etude epidemiologique de ce complexe de levures en identifiant les souches correspondantes aux trois groupes par une analyse moleculaire. Materiel et methodes Notre etude a porte sur 26 souches du complexe C. parapsilosis , prealablement identifiees par les methodes mycologiques classiques, isolees entre janvier 2011 et juin 2014 dans le laboratoire de parasitologie-mycologie de l’hopital La Rabta. Parmi les 26 souches, 19 ont ete isolees a partir d’hemocultures ; 3 a partir de prelevements auriculaires ; 2 a partir de prelevements buccaux et 2 au niveau de catheters. Trois protocoles d’extraction d’ADN genomique du complexe C. parapsilosis ont ete testes : un kit d’extraction (Quick Yeast Genomic DNA Extraction Kit), l’acetate de lithium et l’acetate de potassium. Puis, nous avons mis en place une technique de diagnostic moleculaire par PCR-RFLP. Le gene SADH (716 pb) a ete choisi pour la presence au niveau de sa sequence d’un polymorphisme de restriction BanI. L’amplification du gene SADH permet, apres digestion par l’enzyme de restriction BanI, d’isoler les trois groupes selon le profil obtenu. Resultats Les resultats obtenus au cours de ce travail ont montre que la methode d’extraction utilisant l’acetate de lithium etait la plus efficace en termes de rendement et de profil d’extraction. Le controle par electrophorese de l’amplification du gene codant pour la SADH a confirme l’identification phenotypique en mettant en evidence la bande de 750 pb specifique du complexe C. parapsilosis . Enfin, le controle par electrophorese des reactions de digestion enzymatique par BanI des amplifias du gene SADH a montre, pour les 26 souches testees, la presence de 2 bandes de 200 pb et de 550 pb, correspondant a l’espece C. parapsilosis sensu stricto. Conclusion Ces resultats doivent imperativement etre confirmes par sequencage automatique des produits d’amplification par PCR du gene codant pour la SADH pour chaque souche isolee.