环形泰勒虫微线体-棒状体蛋白基因侧翼序列的hiTAIL-PCR扩增及其生物信息学分析

为扩增环形泰勒虫微线体一棒状体蛋白基因的侧翼序列，从感染环形泰勒虫的淋巴细胞系中提取RNA，反转录合成第1链cDNA。以该cDNA为模板，利用高效热不对称交互PCR法（hiTAIL-PCR）进行扩增，将目的片段连接到pGEM—TEasy载体并进行测序。结果显示，获得了环形泰勒虫微线体一棒状体蛋白基因的5’端侧翼序列，该序列编码894个氨基酸。生物信息学分析结果表明，该蛋白具有信号肽，信号肽剪切部位位于第19～20个氨基酸残基之间，很可能是一种分泌蛋白；经TMHMM2．0预测，该蛋白在第875～892位氨基酸残基部位具有典型的跨膜结构；Motifscan预测的结果显示，环形泰勒虫微线体一棒状体蛋白存在2处N-糖基化位点（153NLSF、333NESM）和15处CK2蛋白激酶磷酸化位点；在该蛋白第500～650位氨基酸残基部分具有较高的抗原性，推测可能是该蛋白与其他蛋白发生相互作用的区域。