Isolement de biomarqueurs cellulaires et moléculaires en oncologie et développement d'approches bas-coût pour leur analyse en routine clinique

L’objectif de ce travail a ete de developper de nouveaux micro-dispositifs pour la capture de cellules tumorales circulantes, ainsi que d’explorer un ensemble de techniques pour faciliter leur analyse aux niveaux cellulaire et moleculaire, en vue d’une utilisation en routine clinique. Une approche innovante de capture des CTCs in vivo, exploitant leurs proprietes physiques specifiques a ete envisagee. La capture au sein de la circulation sanguine du patient, pourrait permettre de sonder un volume plus important et ainsi isoler un plus grand nombre de CTCs en conditions natives et d’obtenir une meilleure representation de leur diversite. Des techniques pour diminuer le cout des analyses, ont ensuite ete explorees de maniere a rendre la biopsie liquide utilisable en routine clinique. Parmi ces techniques, l’assemblage capillaire dirige, utilise pour etirer et immobiliser de facon organisee des biomolecules 1D, a egalement permis d’isoler des fragments d’ADN libre circulant, a partir d’echantillons de sang complet non traites. Dans le contexte de la medecine de precision, une autre approche peut etre de tester les effets d’un certain nombre de medicaments sur les CTCs provenant du patient-meme, de maniere a personnaliser son traitement. Pour cela, apres capture des CTCs, il peut etre interessant de les cultiver in vitro. C’est dans cette perspective que nous avons integre les micro-dispositifs de capture a des plateformes qui permettraient la culture des cellules capturees directement in situ. Pour recreer un environnement propice a leur proliferation, la structuration de materiaux biocompatibles a base de nano-cristaux de cellulose favorisant l’adhesion des cellules a ete investiguee. Nos resultats fournissent un ensemble de technologies qui pourraient contribuer a la democratisation du concept de biopsie liquide en routine clinique.