Etude in vitro de la proteine h-ns, agent de compaction du chromoide bacterien et represseur de transcription

La proteine h-ns est un des nombreux constituants du nucleoide bacterien. Elle a de multiples fonctions : en plus de structurer le genome bacterien en compactant l'adn, cette proteine a la capacite, en se fixant a certains promoteurs, de reguler l'expression de nombreux genes, pour la plupart impliques dans la reponse aux stress de la bacterie. L'abondance de cette proteine structurale (20. 000 copies par cellule) semblait etre incompatible avec une fonction de regulateur qui, pour etre efficace, doit etre present a une concentration generalement proche de l'affinite pour ses cibles sur adn. Cette proteine se fixe sur l'adn selon un modele de nucleation/propagation. L'etude biochimique de mutants negatifs dominants a permis de replacer la fonction des domaines dans ce modele de fixation et de montrer que le protomere est un dimere de la proteine capable de nucleer une fixation par la reconnaissance de sites specifiques de l'adn. La fixation de la proteine se propage ensuite par polymerisation bidirectionnelle des dimeres sur l'adn grace a des interactions entre les proteines. Cette oligomerisation est rendue possible par la presence d'un domaine localise entre les residus 1 et 64. L'etape de nucleation a pu etre etudiee par l'insertion d'un site d'une longueur de 10 paires de bases de tres haute affinite pour h-ns dans un fragment d'adn ou la proteine se fixe de facon non specifique. C'est en fait un demi site qui nuclee la fixation du protomere dimerique. H-ns, a une concentration ou elle est deja oligomerisee, est capable de fixer de facon non-specifique l'adn ne presentant pas de site de nucleation. Cette caracteristique lui permet de structurer le nucleoide en compactant des regions d'adn eloignees sur la sequence. Ces deux modes de fixation specifique et non-specifique permettent une double fonctionnalite.