بهینهسازی روش استخراجRNA از بافت پوست شاخه درختان خانواده مخروطیان

فرآیند استخراج RNA از بافت­های سخت چوبی و به­طور خاص درختان خانواده مخروطیان به‎دلیل داشتن غلظت­های بالایی از ترکیبات فنولیک، پلی­ساکاریدها، متابولیت­های ثانویه و لیگنین، بسیار مشکل است و تا به‎حال هیچ­گونه کیت تجاری برای این منظور ساخته نشده است. در این مطالعه مشکلات فوق برطرف گردیده و روشی سریع، ساده و اقتصادی برای استخراج RNA از بافت ساقه گونه‌های  Cedrus deodara  و  Abies grandis  که هر دو از خانواده مخروطیان می­باشند، ارائه شده است. نسبت جذب نوری در طول موج‌های 260 به 280 و 260 به 230 نانومتر، به‎ترتیب 88/1 و 1/1 برای گونه   Cedrus deodara  و 8/1 و 9/0 برای گونه  Abies grandis  به‎دست آمد. تغییرات صورت گرفته در جهت بهینه‌سازی استخراج RNA نیز شامل استفاده از تیمار پیش‌گرما روی بافر استخراج، کاهش دور سانتریفیوژ حذف آلودگی DNA و حذف DEPC می‌باشد. ساخت cDNA با استفاده از RNA استخراج شده با موفقیت انجام و واکنش RT-PCR باندهای مورد انتظار را تولید نمود. لذا به­نظر می­رسد این روش برای استخراج RNA از بافت­های چوبی مناسب است.