苏淮猪 BMP4 基因3'-UTR区克隆和多态性分析

目的本试验旨在研究梅山猪和苏淮猪 BMP4 （bone morphogenetic protein 4）基因3'-UTR区序列特征，分析苏淮猪 BMP4 基因3'-UTR区SNP位点并了解苏淮猪和高繁殖力猪种梅山猪 BMP4 基因3'-UTR SNP位点多态性。 方法采用克隆测序技术获得苏淮猪 BMP4 基因3'-UTR区序列；利用生物信息学方法分析其序列特征；利用池DNA测序技术筛选SNPs，采用AS-PCR技术分析苏淮猪和梅山猪SNPs位点多态性。 结果苏淮猪 BMP4 基因3'-UTR区序列长度为267 bp，含有一个（AC） 9 微卫星位点和PolyA结构；在苏淮猪 BMP4 基因3'-UTR区20 nt处发现一个SNP，AS-PCR检测到3种基因型（GG、GC和CC）；在苏淮猪中，GG型和G等位基因为优势基因型和优势等位基因，频率分别为0.815和0.887，而在高繁殖力猪种梅山猪中CC型和C等位基因为优势基因型和优势等位基因，频率分别为为0.667和0.770。 结论获得了 BMP4 基因3'-UTR区序列，鉴定了一个新的SNP位点，发现 BMP4 基因3'-UTR区20G>C位点多态性可能与猪繁殖性能有关。