Étude COVL : impact de la charge virale nasopharyngée du SARS-COV-2 sur l’évolution clinique en hospitalisation

Introduction Au 30 avril 2020, plus de 3 millions de personnes dans le monde etaient infectees par le coronavirus responsable du syndrome respiratoire aigu severe 2 (SARS-CoV-2), dont environ 130 000 en France. Le nombre croissant de patients sur une duree courte a surcharge les structures hospitalieres tant en ambulatoire (SAU) qu’en hospitalisation ou en reanimation. L’acide ribonucleique (ARN) du SARS-CoV-2 peut etre detecte dans de nombreux sites anatomiques et liquides biologiques. Les prelevements nasopharynges (NP) sont les plus utilises a des fins de diagnostic. La charge virale (CV) peut etre estimee par le nombre de cycle de RT-PCR necessaire pour obtenir un signal detectable. Les liens entre le niveau de CV sur un prelevement NP et la gravite clinique, la progression et la transmission de la maladie sont insuffisamment connus. Nous avons mene une etude de cohorte retrospective monocentrique afin d’evaluer les liens entre la CV et l’evolution de la maladie liee SARS-CoV-2 lors des quatre premiers mois de l’epidemie en France metropolitaine. Materiels et methodes Etude retrospective descriptive chez les adultes admis du 25 janvier au 30 avril 2020 dans un service des maladies infectieuses pour une infection SARS-CoV-2 biologiquement confirmee. Les donnees epidemiologiques, cliniques, biologiques et therapeutiques ont ete saisies a partir des dossiers medicaux informatises. La charge virale ARN a ete estimee dans les echantillons NP a partir des valeurs du nombre de cycle de RT-PCR necessaire pour obtenir un signal detectable (CT) selon trois techniques successives, detectant toutes sur le gene E. du SARS-CoV-2. Une CV haute correspondait a un nombre de CT bas. Resultats Du 01/03 au 30/04/2020, 159 patients ont eu une estimation de la CV NP a l’admission : 84 hommes et 75 femmes, d’âge median de 66 ans [28–10]. L’evolution a ete defavorable pour 29 (18,2 %) patients. Dix-sept (10,7 %) ont ete transferes en soins intensifs, 12 (7,5 %) patients tous âges. Quatre-vingt-quinze patients ont pu beneficier d’une estimation de la CV fiable. Le CT median etait de 31,49 cycles [17,84–38,88]. Il n’existait pas de difference significative de la CV NP initiale en termes de sexe ou d’âge. Toutefois une tendance d’augmentation avec l’âge existait. Sur une analyse en sous-groupe sur 46 patients ayant eu un par PCR NP une baisse de la CV a ete observe au cours de l’hospitalisation. La CV NP initiale etait plus elevee chez les patients decedes par rapport aux patients transferes en reanimation survivants et aux patients survivants non transferes en reanimation (CT = 25,9, 30,7 et 31,5). Aucun des 29 (18,2 %) patients avec une CV faible (CT ≥ 34) n’est decede. Conclusion La valeur du CT de RT-PCR mesuree par une technique standardisee permet d’estimee la CV des patients sur les prelevements NP. Une CV basse semble associe a un meilleur pronostic. L’estimation de la CV necessite d’etre etudiee sur un plus grand echantillon afin d’etudier son potentiel interet pronostique dans l’evaluation initiale des patients.