Développement et calibration d'un modèle de simulation hôte-pathogène : le cas de la cercosporiose noire du bananier

La cercosporiose noire du bananier, causee par le champignon phytopathogene Mycosphaerella fijiensis, est consideree comme la maladie foliaire la plus dommageable pour les productions bananieres. Dans le but d'approfondir les connaissances sur la dynamique du pathogene et sur les composantes de resistance partielle des varietes de bananier, un modele mecaniste de simulation de la cercosporiose noire a ete developpe, calibre et evalue. Le modele simule avec un pas de temps journalier la croissance d'un bananier et la dynamique du pathogene pendant plusieurs cycles de culture en conditions epidemiologiques optimales. Le modele est constitue de deux sous-modeles et comporte 31 parametres. Le premier sous-modele simule l'architecture et la croissance simplifiees du bananier. Le second sous-modele simule le cycle epidemique detaille du pathogene incluant le processus d'infection, la croissance et la coalescence des lesions sur les feuilles, la sporulation asexuee et sexuee, et la dispersion des spores sur la plante. L'analyse de sensibilite globale du modele a permis d'identifier l'influence principale de trois parametres epidemiologiques : l'efficacite d'infection, la duree d'incubation et la vitesse de croissance des lesions. Ces trois parametres ont ete estimes dans un cadre bayesien avec des methodes MCMC (Markov Chain Monte Carlo) sur des donnees de dynamique des lesions (nombre et surface) sur une variete sensible de plantain. L'evaluation du modele avec un jeu de donnees independant de severite de maladie pendant un cycle de culture a mis en evidence la bonne qualite de la prediction du modele. Des simulations ont confirme l'effet des trois composantes de resistance sur la maladie et ont mis en evidence la forte influence de certains parametres de la croissance du bananier, en particulier le rythme d'emission foliaire, sur la severite de la cercosporiose noire.