Mécanisme moléculaire de l'initiation de la traduction des lentivirus : rôle des structures de la région codante et de la région 5' non traduite

La traduction d’un messager eucaryote est initiee par la liaison d’un complexe ribosomique 43S sur la coiffe situee a l’extremite 5’ de l’ARN. Puis, ce complexe migre jusqu’au codon initiateur ou un ribosome fonctionnel est assemble. Lors d’un mecanisme alternatif appele IRES, la 5’UTR attire directement ou indirectement la sous unite 40S du ribosome sur ou a proximite du codon initiateur. La traduction de l’ARN genomique d’HIV-2 conduit a la synthese de la polyproteine Gag qui est clivee en trois proteines de structure lors de la maturation virale. Trois isoformes de la proteine Gag sont produites par IRES. Etonnamment, la phase codante joue le role de site d’entree interne des ribosomes. La 5’UTR inhibe la traduction de gag. Des structures des regions codantes d’HIV-1, HIV-2 et SIV ont ete modelisees et nous avons pu definir 4 domaines structuraux conserves chez les lentivirus de primates. Par mutations, nous avons mis en evidence l’importance d’un appariement P2, et de deux domaines P3 et P4. Parallelement, la 5’UTR interfere avec cette activite IRES. Nous avons defini l’importance d’une sequence de 27 nucleotides localises dans la region du PBS. Cette sequence est impliquee dans la dimerisation et dans l’initiation de la transcription inverse de l’ARN genomique. Le domaine du PBS interagit avec la region codante d’HIV-2. Ensuite, nous avons etendu nos travaux a l’etude d’un autre lentivirus beaucoup moins decrit : FIV, et nous avons modelise la structure de la 5’UTR et de la phase codante de ce virus, qui ont toutes deux une activite IRES. Les sites d’interaction de la poly proteine Gag avec son ARN messager ont egalement ete definis.