La transcriptomique au service d'une médecine personnalisée : caractérisation physiopathologique et prédiction de réponse thérapeutique. Cas de l'infection par le virus de l'hépatite C et de la polyarthrite rhumatoïde

L'identification de biomarqueurs et de nouvelles cibles therapeutiques constitue un enjeu majeur de la recherche biomedicale visant au developpement de la medecine personnalisee. L'objectif de cette these est d'etudier, a l'aide de puces a ADN, les modulations transcriptionnelles associees a la pathogenese et a la reponse therapeutique dans le cas de deux pathologies: l'infection par le Virus de l'Hepatite C (VHC) et la Polyarthrite Rhumatoide (PR).Des biomarqueurs predictifs de la reponse au traitement standard interferon ont ete identifies grâce a un modele cellulaire ex vivo. Par ailleurs, l'analyse de donnees d'expression de deux modeles d'infection par le VHC (replicon et infectieux) a permis de mettre en evidence les modulations transcriptionnelles resultant de l'activite antivirale de la chloroquine, une alternative potentielle anti-VHC. Dans le cas de la PR, nous avons identifie des biomarqueurs dont l'expression est correlee au succes therapeutique de l'anti-TNF Enbrel.