Intégration de données cliniques et omiques pour la recherche d'information dans le Dossier Patient Informatisé.

Nous decrivons dans cet article le modele de donnees generique Information Retrieval for Omic and Clinical Sciences (IROmiCS) que nous proposons pour gerer les principaux types de donnees omiques (don-nees d'expression, de methylation de l'ADN et variants genomiques). Nous decrivons egalement le langage de requetes que nous avons developpe qui repose sur le modele IROmiCS et qui est dedie a l'interrogation des don-nees cliniques et omiques. Pour valider le modele de donnees propose, ainsi que le langage de requetes associe, des donnees omiques experimentales ont ete integrees dans ce modele ainsi que des donnees de reference telle que les bases Gene du NCBI, Uniprot/Swissprot et la Gene Ontology. Plusieurs types de requetes ciblant des donnees cliniques et des donnees omiques ont ete realisees sur les donnees integrees. Une interface graphique facilite la visualisation des donnees integrees par les cliniciens et les chercheurs. L'outil de recherche a permis de traiter des donnees symboliques, textuelles, numeriques et chronologiques.