Genotipificarión y relación hospedador-específica del virus de la necrosis pancreática infecciosa en Chile

Se analizaron muestras de organos (rinon y bazo) de las principales especies de salmonidos cultivados en Chile a traves de la reaccion en cadena de la polimerasa anidada (PCR anidado) para detectar la presencia del virus de la necrosis pancreatica infecciosa (IPNV). La tecnica resulto ser eficiente y sensible, permitiendo amplificar material genetico del virus para su secuenciacion directamente desde los tejidos, incluso desde muestras que no pudieron ser aisladas en cultivo celular. A traves del analisis filogenetico se detectaron los dos genogrupos descritos previamente en el pais, i.e., europeo (Genogrupo 5) y americano (Genogrupo 1), siendo cuantitativamente predominantes los IPNV del Genogrupo 5 (78,8%). Dentro del Genogrupo 1, se observo claramente la formacion de un sub-grupo de virus chilenos separados de las cepas de referencia (e.g., WB, VR-299), por lo que se propone su denominacion como genotipo chileno. Adicionalmente, se observo una relacion estadistica-mente significativa hospedador-especifica entre los genogrupos identificados: los virus del Genogrupo 5 provienen de Salmo salar mientras que los del Genogrupo 1 provienen de Oncorhynchus mykiss u O. kisutch (P < 0,001). La asociacion de esta relacion hospedador-especifica con la virulencia puede proveer informacion importante para el manejo y control de IPNV en Chile.