Thermodynamique du positionnement des nucléosomes

Le nucleosome est un complexe de proteines qui autorise une meilleure organisation de l'ADN au sein du noyau. L'affinite du nucleosome pour l'ADN varie en fonction de la sequence ce qui altere certains mecanismes biologiques comme la regulation ou l'expression des genes. La description du chapelet nucleosomal comme un fluide 1D de tiges rigides permet des predictions excellentes sur les donnees de reconstitution (in vitro) de nucleosomes. Les differences observees avec le chapelet reel sont interpretees par l'action de facteurs exterieurs au nombre desquels on peut compter : les facteurs de transcription, le remodelage et les chaperonnes. Deux aspects apparaissent essentiels : le positionnement intrinseque du a la sequence et le positionnement statistique issu de l'interaction des nucleosomes avec des obstacles. Les consequences biologiques sont notables : la forme de la chromatine a l'interieur des genes et au niveau du promoteur influence la regulation de l'expression.