Tahap pemotongan (sectioning) menggunakan mikrotom merupakan tahap pembuatan jaringan yang perlu diperhatikan ukuran ketebalannya. Ukuran ketebalan mikrotom yang dapat digunakan yaitu 3-5 μm. Hewan mencit memiliki banyak keunggulan, sedangkan organ ginjal mencit (Mus musculus) merupakan salah satu organ yang sering digunakan dalam penelitian. pewarnaan jaringan yang sering digunakan secara rutin adalah pewarna yang dapat memulas inti dan sitoplasma serta jaringan penyambungnya yaitu pewarnaan Hematoxylin Eosin (HE). Tujuan dari penelitian ini adalah mengetahui perbedaan hasil pewarnaan HE pada histologi ginjal mencit berdasarkan ketebalan mikrotom 3 μm, 6 μm dan 9 μm. Penelitian ini menggunakan jenis penelitian Eksperimental dengan desain penelitian true experimental post test only control group design. Inti sel tampak berwarna biru keunguan pada kelompok pemotongan mikrotom 3 μm dengan rata-rata nilai 2,97. Sitoplasma tampak jelas dan berwarna merah muda pada kelompok pemotongan mikrotom 3 μm dengan rata-rata nilai 3. Keseragaman warna pada kelompok pemotongan mikrotom 3 μm dengan intensitas warna yang merata pada seluruh lapang pandang dengan rata-rata nilai 3. Hasil uji Kruskal Wallis dan Man Whitney pada ketebalan pemotongan mikrotom 3 μm, 6 μm dan 9 μm menunjukkan adanya perbedaan hasil kualitas pewarnaan sediaan preparat ginjal mencit dengan signifikan p= 0.000. Kesimpulan penelitian ini yaitu pemotongan menggunakan organ ginjal mencit dapat menggunakan ketebalan 3 μm.
Influencing factors absorption coloring Hematoxylin Eosin (HE) is one of them size thickness cutting network, cuts are not appropriate and on time coloring that is not appropriate causes the absorption process color No perfect so that moment observation microscopic view of the cell nucleus and cytoplasm seen more pale and faint . Research objectives This is For know difference results coloring Hematoxylin Eosin (HE) on histology kidneys , skin , and colon mice (Mus musculus) based on thickness piece 3 µm, 6 µm, and 9 µm microtomes . Research methods This use method Experimental with nine groups treatment that is thickness cutting 3 μm , 6 μm and 9 μm microtome, then preparation done HE staining and observed quality microscopic includes the cell nucleus, cytoplasm and uniformity color. Data collection uses primary data, reading field done with 400x magnification (40x objective). Data processing uses statistical tests Mann Whitney . The results of the Mann Whitney test show the preparation kidney (p<0.05) that there is difference in a way significant , preparation skin cuts of 3 µm and 6 µm ( p > 0.05) that No There is difference significant cuts of 6 µm and 9 µm, 3 µm and 9 µm ( p< 0.05) that there is difference in a way significant, colon preparation ( p<0.05) that there is difference in a way significant. Conclusion of study This is in the kidneys cutting 3 µm microtome results preparation with quality the best coloring compared to with cutting 6 µm and 9 µm microtome , on skin and colon organs cutting 6 µm microtome results preparation with quality the best coloring compared to with cutting 3 µm and 9 µm microtome.